Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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GRIK3Q13003 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
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