Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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