Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
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RASGEF1BQ0VAM2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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RASGEF1BQ0VAM2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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