Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms