Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD47Q08722 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD47Q08722 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD47Q08722 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD47Q08722 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD47Q08722 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD47Q08722 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD47Q08722 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD47Q08722 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD47Q08722 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD47Q08722 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD47Q08722 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD47Q08722 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD47Q08722 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD47Q08722 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD47Q08722 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD47Q08722 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD47Q08722 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD47Q08722 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD47Q08722 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD47Q08722 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD47Q08722 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD47Q08722 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD47Q08722 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD47Q08722 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD47Q08722 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD47Q08722 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD47Q08722 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD47Q08722 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD47Q08722 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD47Q08722 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD47Q08722 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD47Q08722 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD47Q08722 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD47Q08722 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD47Q08722 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD47Q08722 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD47Q08722 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD47Q08722 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD47Q08722 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD47Q08722 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD47Q08722 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD47Q08722 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD47Q08722 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD47Q08722 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD47Q08722 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD47Q08722 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CD47Q08722 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD47Q08722 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD47Q08722 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD47Q08722 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CD47Q08722 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD47Q08722 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD47Q08722 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD47Q08722 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD47Q08722 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD47Q08722 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD47Q08722 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD47Q08722 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD47Q08722 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD47Q08722 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD47Q08722 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD47Q08722 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD47Q08722 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD47Q08722 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD47Q08722 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD47Q08722 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD47Q08722 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD47Q08722 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD47Q08722 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD47Q08722 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD47Q08722 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD47Q08722 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD47Q08722 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD47Q08722 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD47Q08722 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD47Q08722 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CD47Q08722 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD47Q08722 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD47Q08722 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD47Q08722 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CD47Q08722 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD47Q08722 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD47Q08722 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD47Q08722 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD47Q08722 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CD47Q08722 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD47Q08722 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD47Q08722 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD47Q08722 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD47Q08722 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD47Q08722 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD47Q08722 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD47Q08722 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD47Q08722 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD47Q08722 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD47Q08722 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD47Q08722 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD47Q08722 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD47Q08722 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms