Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms