Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms