Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms