Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms