Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms