Protein–RNA interactions for Protein: Q05932

FPGS, Folylpolyglutamate synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FPGSQ05932 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FPGSQ05932 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms