Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms