Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms