Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms