Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms