Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms