Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
XPCQ01831 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
XPCQ01831 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
XPCQ01831 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
XPCQ01831 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
XPCQ01831 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
XPCQ01831 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
XPCQ01831 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
XPCQ01831 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
XPCQ01831 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
XPCQ01831 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
XPCQ01831 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
XPCQ01831 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
XPCQ01831 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
XPCQ01831 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
XPCQ01831 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
XPCQ01831 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
XPCQ01831 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XPCQ01831 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XPCQ01831 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
XPCQ01831 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
XPCQ01831 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
XPCQ01831 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
XPCQ01831 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
XPCQ01831 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XPCQ01831 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XPCQ01831 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XPCQ01831 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
XPCQ01831 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XPCQ01831 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
XPCQ01831 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
XPCQ01831 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XPCQ01831 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XPCQ01831 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XPCQ01831 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
XPCQ01831 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
XPCQ01831 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XPCQ01831 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XPCQ01831 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
XPCQ01831 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
XPCQ01831 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
XPCQ01831 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
XPCQ01831 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
XPCQ01831 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
XPCQ01831 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
XPCQ01831 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
XPCQ01831 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XPCQ01831 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XPCQ01831 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XPCQ01831 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XPCQ01831 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XPCQ01831 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XPCQ01831 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
XPCQ01831 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
XPCQ01831 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
XPCQ01831 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XPCQ01831 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XPCQ01831 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
XPCQ01831 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XPCQ01831 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XPCQ01831 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
XPCQ01831 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
XPCQ01831 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XPCQ01831 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XPCQ01831 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
XPCQ01831 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XPCQ01831 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XPCQ01831 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XPCQ01831 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
XPCQ01831 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XPCQ01831 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
XPCQ01831 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
XPCQ01831 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
XPCQ01831 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XPCQ01831 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
XPCQ01831 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XPCQ01831 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XPCQ01831 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
XPCQ01831 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
XPCQ01831 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XPCQ01831 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XPCQ01831 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XPCQ01831 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XPCQ01831 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
XPCQ01831 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XPCQ01831 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
XPCQ01831 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
XPCQ01831 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
XPCQ01831 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
XPCQ01831 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
XPCQ01831 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
XPCQ01831 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
XPCQ01831 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
XPCQ01831 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XPCQ01831 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XPCQ01831 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XPCQ01831 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XPCQ01831 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
XPCQ01831 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
XPCQ01831 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms