Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms