Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms