Protein–RNA interactions for Protein: P78556

CCL20, C-C motif chemokine 20, humanhuman

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Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20P78556 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL20P78556 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL20P78556 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL20P78556 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL20P78556 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL20P78556 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL20P78556 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL20P78556 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL20P78556 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL20P78556 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL20P78556 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL20P78556 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL20P78556 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL20P78556 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL20P78556 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL20P78556 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL20P78556 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL20P78556 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL20P78556 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL20P78556 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL20P78556 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL20P78556 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL20P78556 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL20P78556 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL20P78556 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL20P78556 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL20P78556 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL20P78556 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL20P78556 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL20P78556 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL20P78556 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL20P78556 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL20P78556 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL20P78556 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL20P78556 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL20P78556 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL20P78556 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL20P78556 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL20P78556 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL20P78556 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL20P78556 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL20P78556 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL20P78556 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL20P78556 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL20P78556 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL20P78556 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL20P78556 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL20P78556 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL20P78556 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL20P78556 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL20P78556 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL20P78556 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL20P78556 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL20P78556 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL20P78556 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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CCL20P78556 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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CCL20P78556 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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CCL20P78556 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL20P78556 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL20P78556 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL20P78556 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL20P78556 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL20P78556 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL20P78556 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL20P78556 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL20P78556 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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CCL20P78556 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL20P78556 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL20P78556 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL20P78556 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL20P78556 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL20P78556 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL20P78556 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL20P78556 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL20P78556 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL20P78556 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL20P78556 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL20P78556 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL20P78556 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL20P78556 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL20P78556 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL20P78556 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL20P78556 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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