Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms