Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTG1P63261 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms