Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKP1P63208 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKP1P63208 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKP1P63208 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKP1P63208 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKP1P63208 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKP1P63208 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKP1P63208 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKP1P63208 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKP1P63208 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKP1P63208 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKP1P63208 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKP1P63208 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKP1P63208 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKP1P63208 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKP1P63208 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKP1P63208 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKP1P63208 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKP1P63208 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKP1P63208 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKP1P63208 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SKP1P63208 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKP1P63208 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKP1P63208 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKP1P63208 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKP1P63208 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKP1P63208 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKP1P63208 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKP1P63208 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKP1P63208 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKP1P63208 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKP1P63208 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKP1P63208 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKP1P63208 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKP1P63208 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKP1P63208 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKP1P63208 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKP1P63208 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKP1P63208 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKP1P63208 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKP1P63208 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKP1P63208 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKP1P63208 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKP1P63208 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKP1P63208 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKP1P63208 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKP1P63208 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKP1P63208 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKP1P63208 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SKP1P63208 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKP1P63208 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SKP1P63208 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKP1P63208 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKP1P63208 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SKP1P63208 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKP1P63208 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKP1P63208 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKP1P63208 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKP1P63208 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKP1P63208 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKP1P63208 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKP1P63208 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKP1P63208 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKP1P63208 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKP1P63208 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKP1P63208 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKP1P63208 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKP1P63208 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKP1P63208 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKP1P63208 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKP1P63208 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKP1P63208 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP1P63208 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP1P63208 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP1P63208 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP1P63208 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP1P63208 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP1P63208 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP1P63208 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP1P63208 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP1P63208 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP1P63208 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP1P63208 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP1P63208 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP1P63208 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP1P63208 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP1P63208 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP1P63208 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP1P63208 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP1P63208 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP1P63208 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP1P63208 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP1P63208 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP1P63208 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP1P63208 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP1P63208 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP1P63208 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP1P63208 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP1P63208 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP1P63208 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms