Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms