Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTBP60709 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTBP60709 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTBP60709 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTBP60709 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTBP60709 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTBP60709 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTBP60709 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTBP60709 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTBP60709 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTBP60709 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTBP60709 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTBP60709 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTBP60709 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTBP60709 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTBP60709 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTBP60709 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTBP60709 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTBP60709 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTBP60709 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTBP60709 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTBP60709 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTBP60709 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTBP60709 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTBP60709 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTBP60709 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTBP60709 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTBP60709 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTBP60709 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTBP60709 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTBP60709 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTBP60709 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTBP60709 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTBP60709 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTBP60709 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTBP60709 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTBP60709 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTBP60709 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTBP60709 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTBP60709 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTBP60709 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTBP60709 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTBP60709 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTBP60709 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTBP60709 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTBP60709 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTBP60709 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTBP60709 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTBP60709 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTBP60709 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTBP60709 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTBP60709 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTBP60709 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTBP60709 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTBP60709 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTBP60709 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTBP60709 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTBP60709 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTBP60709 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTBP60709 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTBP60709 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTBP60709 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTBP60709 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTBP60709 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTBP60709 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTBP60709 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTBP60709 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTBP60709 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTBP60709 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTBP60709 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTBP60709 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTBP60709 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTBP60709 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTBP60709 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTBP60709 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTBP60709 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTBP60709 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTBP60709 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTBP60709 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTBP60709 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTBP60709 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTBP60709 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTBP60709 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTBP60709 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTBP60709 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTBP60709 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTBP60709 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTBP60709 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTBP60709 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTBP60709 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTBP60709 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTBP60709 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTBP60709 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTBP60709 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTBP60709 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTBP60709 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTBP60709 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTBP60709 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTBP60709 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTBP60709 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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