Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms