Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELLP55199 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELLP55199 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELLP55199 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELLP55199 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELLP55199 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ELLP55199 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ELLP55199 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELLP55199 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELLP55199 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ELLP55199 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ELLP55199 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELLP55199 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELLP55199 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELLP55199 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELLP55199 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELLP55199 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELLP55199 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELLP55199 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELLP55199 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELLP55199 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELLP55199 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELLP55199 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELLP55199 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELLP55199 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELLP55199 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELLP55199 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELLP55199 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELLP55199 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELLP55199 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELLP55199 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELLP55199 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELLP55199 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELLP55199 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELLP55199 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELLP55199 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELLP55199 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ELLP55199 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELLP55199 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELLP55199 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELLP55199 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELLP55199 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELLP55199 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELLP55199 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELLP55199 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELLP55199 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELLP55199 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELLP55199 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELLP55199 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELLP55199 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELLP55199 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELLP55199 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELLP55199 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELLP55199 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELLP55199 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELLP55199 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELLP55199 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELLP55199 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELLP55199 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELLP55199 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELLP55199 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELLP55199 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ELLP55199 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ELLP55199 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ELLP55199 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ELLP55199 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ELLP55199 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ELLP55199 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ELLP55199 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ELLP55199 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ELLP55199 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ELLP55199 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ELLP55199 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ELLP55199 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ELLP55199 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ELLP55199 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ELLP55199 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ELLP55199 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ELLP55199 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ELLP55199 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ELLP55199 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ELLP55199 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ELLP55199 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ELLP55199 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ELLP55199 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ELLP55199 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ELLP55199 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ELLP55199 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ELLP55199 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ELLP55199 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ELLP55199 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ELLP55199 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ELLP55199 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ELLP55199 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ELLP55199 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ELLP55199 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ELLP55199 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ELLP55199 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ELLP55199 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ELLP55199 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms