Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AFDNP55196 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AFDNP55196 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
AFDNP55196 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AFDNP55196 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AFDNP55196 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AFDNP55196 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AFDNP55196 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AFDNP55196 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AFDNP55196 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AFDNP55196 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AFDNP55196 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
AFDNP55196 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AFDNP55196 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AFDNP55196 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AFDNP55196 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AFDNP55196 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AFDNP55196 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AFDNP55196 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
AFDNP55196 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AFDNP55196 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AFDNP55196 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AFDNP55196 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AFDNP55196 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AFDNP55196 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AFDNP55196 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AFDNP55196 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AFDNP55196 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AFDNP55196 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AFDNP55196 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AFDNP55196 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AFDNP55196 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AFDNP55196 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AFDNP55196 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AFDNP55196 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AFDNP55196 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AFDNP55196 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AFDNP55196 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AFDNP55196 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AFDNP55196 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
AFDNP55196 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AFDNP55196 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AFDNP55196 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AFDNP55196 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AFDNP55196 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AFDNP55196 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AFDNP55196 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AFDNP55196 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AFDNP55196 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AFDNP55196 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AFDNP55196 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AFDNP55196 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AFDNP55196 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
AFDNP55196 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AFDNP55196 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AFDNP55196 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AFDNP55196 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AFDNP55196 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
AFDNP55196 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
AFDNP55196 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AFDNP55196 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AFDNP55196 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AFDNP55196 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
AFDNP55196 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AFDNP55196 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AFDNP55196 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AFDNP55196 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AFDNP55196 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AFDNP55196 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AFDNP55196 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AFDNP55196 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AFDNP55196 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AFDNP55196 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AFDNP55196 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AFDNP55196 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AFDNP55196 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AFDNP55196 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AFDNP55196 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
AFDNP55196 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
AFDNP55196 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AFDNP55196 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AFDNP55196 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AFDNP55196 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AFDNP55196 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AFDNP55196 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AFDNP55196 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AFDNP55196 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AFDNP55196 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AFDNP55196 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AFDNP55196 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AFDNP55196 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
AFDNP55196 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AFDNP55196 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AFDNP55196 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AFDNP55196 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AFDNP55196 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AFDNP55196 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AFDNP55196 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AFDNP55196 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AFDNP55196 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms