Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms