Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ETV1P50549 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ETV1P50549 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ETV1P50549 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ETV1P50549 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ETV1P50549 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ETV1P50549 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ETV1P50549 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ETV1P50549 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ETV1P50549 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ETV1P50549 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ETV1P50549 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ETV1P50549 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ETV1P50549 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ETV1P50549 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ETV1P50549 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ETV1P50549 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ETV1P50549 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ETV1P50549 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ETV1P50549 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ETV1P50549 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ETV1P50549 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ETV1P50549 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ETV1P50549 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ETV1P50549 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ETV1P50549 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ETV1P50549 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ETV1P50549 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ETV1P50549 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ETV1P50549 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ETV1P50549 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ETV1P50549 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ETV1P50549 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ETV1P50549 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ETV1P50549 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ETV1P50549 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ETV1P50549 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ETV1P50549 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ETV1P50549 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETV1P50549 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETV1P50549 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETV1P50549 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETV1P50549 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETV1P50549 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETV1P50549 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETV1P50549 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETV1P50549 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETV1P50549 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETV1P50549 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETV1P50549 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETV1P50549 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETV1P50549 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETV1P50549 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETV1P50549 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETV1P50549 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETV1P50549 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETV1P50549 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETV1P50549 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETV1P50549 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETV1P50549 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ETV1P50549 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETV1P50549 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETV1P50549 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETV1P50549 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETV1P50549 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ETV1P50549 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETV1P50549 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETV1P50549 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETV1P50549 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETV1P50549 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETV1P50549 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETV1P50549 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETV1P50549 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETV1P50549 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETV1P50549 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETV1P50549 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETV1P50549 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETV1P50549 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETV1P50549 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETV1P50549 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETV1P50549 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETV1P50549 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETV1P50549 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETV1P50549 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETV1P50549 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ETV1P50549 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ETV1P50549 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ETV1P50549 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ETV1P50549 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ETV1P50549 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ETV1P50549 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETV1P50549 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETV1P50549 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETV1P50549 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ETV1P50549 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETV1P50549 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETV1P50549 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETV1P50549 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETV1P50549 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ETV1P50549 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms