Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms