Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP5P45974 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP5P45974 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP5P45974 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP5P45974 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP5P45974 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP5P45974 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP5P45974 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP5P45974 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP5P45974 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP5P45974 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP5P45974 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP5P45974 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP5P45974 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
USP5P45974 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP5P45974 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP5P45974 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
USP5P45974 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP5P45974 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP5P45974 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP5P45974 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP5P45974 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP5P45974 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP5P45974 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP5P45974 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP5P45974 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP5P45974 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP5P45974 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP5P45974 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP5P45974 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP5P45974 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP5P45974 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP5P45974 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP5P45974 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP5P45974 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP5P45974 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP5P45974 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP5P45974 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP5P45974 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP5P45974 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP5P45974 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP5P45974 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
USP5P45974 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP5P45974 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP5P45974 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP5P45974 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP5P45974 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP5P45974 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP5P45974 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP5P45974 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP5P45974 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP5P45974 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP5P45974 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP5P45974 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP5P45974 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP5P45974 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP5P45974 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP5P45974 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP5P45974 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP5P45974 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP5P45974 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP5P45974 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP5P45974 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
USP5P45974 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP5P45974 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP5P45974 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP5P45974 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP5P45974 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP5P45974 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP5P45974 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP5P45974 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP5P45974 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
USP5P45974 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP5P45974 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP5P45974 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP5P45974 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP5P45974 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP5P45974 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP5P45974 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP5P45974 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP5P45974 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP5P45974 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP5P45974 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP5P45974 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP5P45974 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP5P45974 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP5P45974 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP5P45974 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP5P45974 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
USP5P45974 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP5P45974 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP5P45974 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP5P45974 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
USP5P45974 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP5P45974 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP5P45974 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP5P45974 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP5P45974 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP5P45974 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP5P45974 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms