Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATA4P43694 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATA4P43694 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATA4P43694 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATA4P43694 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATA4P43694 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATA4P43694 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATA4P43694 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATA4P43694 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATA4P43694 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATA4P43694 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATA4P43694 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GATA4P43694 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GATA4P43694 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATA4P43694 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATA4P43694 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATA4P43694 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATA4P43694 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATA4P43694 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATA4P43694 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATA4P43694 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATA4P43694 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATA4P43694 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GATA4P43694 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATA4P43694 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATA4P43694 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATA4P43694 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATA4P43694 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATA4P43694 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATA4P43694 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATA4P43694 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATA4P43694 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATA4P43694 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATA4P43694 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATA4P43694 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATA4P43694 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATA4P43694 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATA4P43694 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATA4P43694 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATA4P43694 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATA4P43694 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GATA4P43694 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATA4P43694 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATA4P43694 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATA4P43694 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATA4P43694 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATA4P43694 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATA4P43694 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATA4P43694 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATA4P43694 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATA4P43694 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATA4P43694 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATA4P43694 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATA4P43694 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATA4P43694 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATA4P43694 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATA4P43694 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATA4P43694 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATA4P43694 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA4P43694 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA4P43694 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA4P43694 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA4P43694 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA4P43694 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA4P43694 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA4P43694 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA4P43694 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA4P43694 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA4P43694 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA4P43694 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA4P43694 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA4P43694 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA4P43694 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA4P43694 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA4P43694 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA4P43694 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA4P43694 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA4P43694 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA4P43694 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA4P43694 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA4P43694 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA4P43694 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA4P43694 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA4P43694 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA4P43694 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA4P43694 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA4P43694 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA4P43694 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA4P43694 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA4P43694 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA4P43694 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA4P43694 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA4P43694 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA4P43694 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA4P43694 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA4P43694 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA4P43694 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA4P43694 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA4P43694 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA4P43694 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms