Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MDH1P40925 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MDH1P40925 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MDH1P40925 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MDH1P40925 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
MDH1P40925 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
MDH1P40925 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
MDH1P40925 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
MDH1P40925 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDH1P40925 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDH1P40925 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDH1P40925 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDH1P40925 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDH1P40925 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDH1P40925 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDH1P40925 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDH1P40925 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
MDH1P40925 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDH1P40925 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDH1P40925 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDH1P40925 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDH1P40925 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDH1P40925 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDH1P40925 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDH1P40925 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDH1P40925 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDH1P40925 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDH1P40925 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDH1P40925 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDH1P40925 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDH1P40925 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDH1P40925 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDH1P40925 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDH1P40925 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
MDH1P40925 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDH1P40925 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDH1P40925 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDH1P40925 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDH1P40925 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDH1P40925 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDH1P40925 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDH1P40925 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDH1P40925 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDH1P40925 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDH1P40925 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDH1P40925 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDH1P40925 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDH1P40925 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDH1P40925 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDH1P40925 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDH1P40925 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDH1P40925 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDH1P40925 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDH1P40925 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDH1P40925 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDH1P40925 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDH1P40925 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDH1P40925 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDH1P40925 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDH1P40925 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDH1P40925 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDH1P40925 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDH1P40925 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDH1P40925 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDH1P40925 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDH1P40925 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDH1P40925 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDH1P40925 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDH1P40925 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDH1P40925 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDH1P40925 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDH1P40925 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDH1P40925 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDH1P40925 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDH1P40925 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDH1P40925 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDH1P40925 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDH1P40925 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
MDH1P40925 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDH1P40925 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDH1P40925 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDH1P40925 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDH1P40925 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDH1P40925 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDH1P40925 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDH1P40925 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDH1P40925 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDH1P40925 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDH1P40925 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDH1P40925 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDH1P40925 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDH1P40925 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDH1P40925 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDH1P40925 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDH1P40925 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDH1P40925 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDH1P40925 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDH1P40925 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDH1P40925 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MDH1P40925 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms