Protein–RNA interactions for Protein: P35913

PDE6B, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6BP35913 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms