Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 AC138123.2-201ENST00000550324 579 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 AC022469.1-201ENST00000555291 656 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 TMPRSS11GP-201ENST00000431070 1204 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
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HOXD11P31277 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 C14orf159-210ENST00000518665 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 ZBTB20-AS5-203ENST00000628886 819 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 ACAT1-202ENST00000299355 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 WFDC13-201ENST00000305479 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 AL713923.1-201ENST00000414071 378 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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HOXD11P31277 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
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HOXD11P31277 RN7SL519P-201ENST00000497925 288 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
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HOXD11P31277 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 LINC01490-201ENST00000548705 638 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 AC092683.1-202ENST00000620023 754 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 AC159540.2-201ENST00000621110 754 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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