Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms