Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms