Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP1P29466 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP1P29466 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP1P29466 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP1P29466 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP1P29466 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP1P29466 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP1P29466 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP1P29466 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP1P29466 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP1P29466 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP1P29466 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP1P29466 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP1P29466 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP1P29466 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP1P29466 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CASP1P29466 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CASP1P29466 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CASP1P29466 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CASP1P29466 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CASP1P29466 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CASP1P29466 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CASP1P29466 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CASP1P29466 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CASP1P29466 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CASP1P29466 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CASP1P29466 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CASP1P29466 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CASP1P29466 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CASP1P29466 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CASP1P29466 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CASP1P29466 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CASP1P29466 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CASP1P29466 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CASP1P29466 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CASP1P29466 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CASP1P29466 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CASP1P29466 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CASP1P29466 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CASP1P29466 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASP1P29466 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASP1P29466 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASP1P29466 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASP1P29466 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASP1P29466 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASP1P29466 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASP1P29466 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASP1P29466 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASP1P29466 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASP1P29466 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASP1P29466 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASP1P29466 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASP1P29466 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASP1P29466 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASP1P29466 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASP1P29466 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASP1P29466 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASP1P29466 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASP1P29466 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASP1P29466 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASP1P29466 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASP1P29466 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASP1P29466 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASP1P29466 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASP1P29466 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CASP1P29466 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CASP1P29466 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CASP1P29466 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CASP1P29466 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CASP1P29466 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CASP1P29466 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CASP1P29466 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CASP1P29466 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CASP1P29466 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CASP1P29466 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CASP1P29466 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CASP1P29466 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CASP1P29466 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CASP1P29466 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CASP1P29466 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CASP1P29466 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CASP1P29466 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CASP1P29466 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASP1P29466 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASP1P29466 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASP1P29466 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CASP1P29466 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASP1P29466 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASP1P29466 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASP1P29466 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASP1P29466 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASP1P29466 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CASP1P29466 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASP1P29466 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASP1P29466 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASP1P29466 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASP1P29466 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASP1P29466 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASP1P29466 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASP1P29466 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms