Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEX2P28328 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEX2P28328 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEX2P28328 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEX2P28328 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEX2P28328 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEX2P28328 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEX2P28328 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEX2P28328 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEX2P28328 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEX2P28328 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEX2P28328 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEX2P28328 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEX2P28328 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEX2P28328 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEX2P28328 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEX2P28328 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEX2P28328 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEX2P28328 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEX2P28328 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEX2P28328 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEX2P28328 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEX2P28328 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEX2P28328 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEX2P28328 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEX2P28328 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEX2P28328 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEX2P28328 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PEX2P28328 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEX2P28328 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEX2P28328 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PEX2P28328 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX2P28328 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX2P28328 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX2P28328 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX2P28328 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX2P28328 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX2P28328 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX2P28328 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX2P28328 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX2P28328 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX2P28328 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX2P28328 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX2P28328 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX2P28328 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX2P28328 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX2P28328 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX2P28328 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX2P28328 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX2P28328 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX2P28328 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX2P28328 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX2P28328 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX2P28328 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX2P28328 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX2P28328 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX2P28328 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX2P28328 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX2P28328 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX2P28328 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX2P28328 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX2P28328 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX2P28328 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX2P28328 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX2P28328 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX2P28328 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX2P28328 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX2P28328 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX2P28328 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX2P28328 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX2P28328 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX2P28328 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX2P28328 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX2P28328 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX2P28328 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX2P28328 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX2P28328 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX2P28328 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX2P28328 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX2P28328 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX2P28328 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX2P28328 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX2P28328 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX2P28328 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX2P28328 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX2P28328 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX2P28328 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX2P28328 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX2P28328 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX2P28328 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX2P28328 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX2P28328 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX2P28328 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX2P28328 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX2P28328 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX2P28328 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX2P28328 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX2P28328 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEX2P28328 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEX2P28328 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms