Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms