Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMLP26374 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMLP26374 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMLP26374 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMLP26374 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMLP26374 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMLP26374 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMLP26374 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMLP26374 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMLP26374 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMLP26374 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMLP26374 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMLP26374 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMLP26374 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMLP26374 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMLP26374 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMLP26374 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMLP26374 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMLP26374 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMLP26374 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMLP26374 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMLP26374 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMLP26374 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMLP26374 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMLP26374 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMLP26374 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMLP26374 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMLP26374 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMLP26374 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMLP26374 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMLP26374 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMLP26374 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMLP26374 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMLP26374 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMLP26374 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMLP26374 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMLP26374 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMLP26374 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMLP26374 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMLP26374 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMLP26374 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMLP26374 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMLP26374 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMLP26374 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMLP26374 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMLP26374 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMLP26374 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMLP26374 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMLP26374 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMLP26374 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMLP26374 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMLP26374 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMLP26374 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMLP26374 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMLP26374 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMLP26374 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMLP26374 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMLP26374 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMLP26374 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMLP26374 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMLP26374 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMLP26374 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMLP26374 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMLP26374 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMLP26374 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMLP26374 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMLP26374 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMLP26374 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMLP26374 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMLP26374 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMLP26374 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMLP26374 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMLP26374 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMLP26374 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMLP26374 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMLP26374 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMLP26374 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMLP26374 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMLP26374 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMLP26374 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMLP26374 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMLP26374 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMLP26374 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMLP26374 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMLP26374 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMLP26374 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMLP26374 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMLP26374 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMLP26374 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMLP26374 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMLP26374 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMLP26374 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMLP26374 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMLP26374 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMLP26374 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMLP26374 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMLP26374 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMLP26374 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMLP26374 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMLP26374 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms