Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRDP23468 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
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