Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HRCP23327 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HRCP23327 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HRCP23327 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HRCP23327 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HRCP23327 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HRCP23327 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HRCP23327 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HRCP23327 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HRCP23327 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HRCP23327 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HRCP23327 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HRCP23327 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HRCP23327 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HRCP23327 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HRCP23327 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HRCP23327 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HRCP23327 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HRCP23327 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HRCP23327 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HRCP23327 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HRCP23327 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HRCP23327 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HRCP23327 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HRCP23327 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HRCP23327 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
HRCP23327 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HRCP23327 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HRCP23327 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HRCP23327 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HRCP23327 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HRCP23327 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HRCP23327 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HRCP23327 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HRCP23327 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HRCP23327 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HRCP23327 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HRCP23327 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HRCP23327 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
HRCP23327 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
HRCP23327 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HRCP23327 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HRCP23327 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HRCP23327 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HRCP23327 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HRCP23327 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HRCP23327 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HRCP23327 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HRCP23327 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HRCP23327 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HRCP23327 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HRCP23327 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HRCP23327 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HRCP23327 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HRCP23327 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HRCP23327 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HRCP23327 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
HRCP23327 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
HRCP23327 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HRCP23327 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HRCP23327 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HRCP23327 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HRCP23327 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HRCP23327 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HRCP23327 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HRCP23327 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HRCP23327 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HRCP23327 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HRCP23327 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HRCP23327 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HRCP23327 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HRCP23327 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HRCP23327 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HRCP23327 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HRCP23327 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HRCP23327 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HRCP23327 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HRCP23327 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HRCP23327 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
HRCP23327 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HRCP23327 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
HRCP23327 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HRCP23327 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HRCP23327 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HRCP23327 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HRCP23327 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HRCP23327 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HRCP23327 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HRCP23327 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HRCP23327 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HRCP23327 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HRCP23327 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HRCP23327 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HRCP23327 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HRCP23327 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HRCP23327 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HRCP23327 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HRCP23327 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HRCP23327 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HRCP23327 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms