Protein–RNA interactions for Protein: P22888

LHCGR, Lutropin-choriogonadotropic hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHCGRP22888 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LHCGRP22888 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LHCGRP22888 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHCGRP22888 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHCGRP22888 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHCGRP22888 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHCGRP22888 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHCGRP22888 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHCGRP22888 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHCGRP22888 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHCGRP22888 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHCGRP22888 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms