Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms