Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATF3P18847 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATF3P18847 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ATF3P18847 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATF3P18847 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATF3P18847 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATF3P18847 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATF3P18847 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ATF3P18847 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ATF3P18847 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATF3P18847 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ATF3P18847 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATF3P18847 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATF3P18847 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATF3P18847 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATF3P18847 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATF3P18847 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATF3P18847 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATF3P18847 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATF3P18847 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATF3P18847 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATF3P18847 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ATF3P18847 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ATF3P18847 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATF3P18847 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATF3P18847 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATF3P18847 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATF3P18847 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ATF3P18847 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATF3P18847 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATF3P18847 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATF3P18847 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATF3P18847 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATF3P18847 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATF3P18847 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATF3P18847 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATF3P18847 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATF3P18847 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATF3P18847 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATF3P18847 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ATF3P18847 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATF3P18847 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATF3P18847 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ATF3P18847 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATF3P18847 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATF3P18847 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ATF3P18847 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATF3P18847 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATF3P18847 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATF3P18847 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATF3P18847 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATF3P18847 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATF3P18847 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATF3P18847 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATF3P18847 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATF3P18847 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATF3P18847 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATF3P18847 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATF3P18847 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATF3P18847 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATF3P18847 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATF3P18847 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATF3P18847 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ATF3P18847 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATF3P18847 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATF3P18847 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATF3P18847 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATF3P18847 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATF3P18847 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATF3P18847 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATF3P18847 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATF3P18847 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATF3P18847 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATF3P18847 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATF3P18847 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATF3P18847 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
ATF3P18847 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATF3P18847 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ATF3P18847 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATF3P18847 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATF3P18847 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATF3P18847 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATF3P18847 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATF3P18847 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ATF3P18847 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATF3P18847 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATF3P18847 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATF3P18847 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ATF3P18847 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ATF3P18847 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATF3P18847 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATF3P18847 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATF3P18847 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATF3P18847 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATF3P18847 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATF3P18847 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATF3P18847 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATF3P18847 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATF3P18847 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATF3P18847 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms