Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms