Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNB3P16520 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNB3P16520 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNB3P16520 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNB3P16520 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNB3P16520 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNB3P16520 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNB3P16520 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNB3P16520 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNB3P16520 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNB3P16520 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNB3P16520 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNB3P16520 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNB3P16520 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNB3P16520 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GNB3P16520 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNB3P16520 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNB3P16520 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNB3P16520 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNB3P16520 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNB3P16520 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNB3P16520 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB3P16520 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB3P16520 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB3P16520 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB3P16520 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB3P16520 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB3P16520 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB3P16520 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB3P16520 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB3P16520 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB3P16520 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB3P16520 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB3P16520 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB3P16520 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB3P16520 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB3P16520 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB3P16520 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB3P16520 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB3P16520 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB3P16520 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB3P16520 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB3P16520 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB3P16520 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB3P16520 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB3P16520 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB3P16520 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB3P16520 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB3P16520 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB3P16520 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB3P16520 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB3P16520 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB3P16520 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB3P16520 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB3P16520 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB3P16520 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB3P16520 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB3P16520 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB3P16520 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB3P16520 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB3P16520 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB3P16520 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB3P16520 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB3P16520 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB3P16520 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB3P16520 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB3P16520 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB3P16520 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB3P16520 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB3P16520 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB3P16520 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB3P16520 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB3P16520 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB3P16520 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB3P16520 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB3P16520 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB3P16520 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB3P16520 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB3P16520 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB3P16520 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB3P16520 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB3P16520 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB3P16520 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB3P16520 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB3P16520 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB3P16520 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB3P16520 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB3P16520 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB3P16520 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB3P16520 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB3P16520 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB3P16520 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB3P16520 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB3P16520 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB3P16520 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB3P16520 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB3P16520 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB3P16520 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNB3P16520 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNB3P16520 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms