Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms